وكالة التخطيط والتطوير بكلية ينبع الصناعية تهدف إلى دعم تحقيق رؤية ورسالة الكلية بما يتماشى مع أهداف الهيئة الملكية وقطاع التعليم. تتولى الوكالة متابعة تنفيذ الخطط الاستراتيجية والتحقق من كفاءتها وضمان جودة الأداء. كما تركز على متابعة المناهج الأكاديمية وتطويرها، وتحليل مخرجات التعلم بما يعزز جودة العملية التعليمية. وتتابع الوكالة مؤشرات الأداء وتقدم مقترحات تطويرية استراتيجية تسهم في تحقيق أهداف الكلية والارتقاء بتميزها المؤسسي.